南通外向型农业综合开发区机构设置：

（一）办公室

（二）财审局

（三）经济发展局

（四）规划建设局

（五）综合行政执法局

（六）安全生产监督管理局

（七）农村工作局

（八）县自然资源和规划局外农分局

按照有关法律、法规和政策规定，设立区（街）人大工委、纪工委、工会、共青团、妇联、人民武装等组织。建立基层政协联络工作机制。